Kelembagaan Mahasiswa merupakan lembaga yang dikelola oleh mahasiswa, terdiri dari BEM dan himpunan mahasiswa. Lembaga ini sebagai wadah mahasiswa mempererat silaturahmi antara mahasiswa pada masing- masing program studi dan bertukar ide serta pemikiran. Lembaga ini juga sebagai ajang mahasiswa belajar keorganisasian, sehingga menjadi bekal ketrampilan dalam dunia kerja. Lembaga Mahasiswa terdiri dari BEM (Badan Eksekutif Mahasiswa) sebagai lembaga yang menauingi seluruh mahasiswa Alma Ata. Setiap program studi mempunyai himpunan mahasiswa (HIMA) yang menaungi seluruh mahasiswa pada sekup program studi.